mysql
Смена директории баз данных MySQL
Описание переноса рабочего каталога баз данных MySQL в другой раздел/каталог
Удаление старых, бинарных логов MySQL
Бинарное журналирование включает параметр log-bin. По умолчанию MySQL не удаляет бинарные логи и при интенсивном использовании БД, рано или поздно, столкнетесь с проблемой нехватки места на разделе.